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用大数据推动生物多样性研究

http://www.chla.com.cn 2017-08-10 来源:光明日报 作者:马克平 发表评论(0)

  亚洲急需生物多样性大数据

  在基础相对薄弱的亚洲,开展区域尺度植物多样性数据库建设充满了挑战。很多数据集都是未公开发表或发布的,特别是植物分布数据多是当地语言的,而且难以搜集到;大多数国家的植物学研究都是境外专家为主完成的,有时寻找相关的分类学家都很困难,索取资料更难;各国研究水平参差不齐,在持续上百年的时间里,物种分类学概念在变化,多源异构数据汇总后,清理与整合难度很大。

  因此,我国植物学家希望配合国家的大数据战略加紧科研,一方面为我国的经济发展做好基础学科方面的贡献,另一方面带动整个亚洲的植物学科大踏步向前进。于是,由我国牵头的“亚洲植物多样性数字化计划”(MappingAsiaPlants,MAP)应运而生。这一项目旨在针对亚洲各地区目前已有的植物信息资源,如物种名录、相关数据库、网站资源等开展全面调研。

  “亚洲植物多样性数字化计划”旨在建立亚洲植物学信息的大数据在线平台,为亚洲植物多样性保护与研究提供综合性基础信息和跨学科数据挖掘环境。第一阶段(2016年—2020年)的重点在于建立亚洲高等植物物种名录与分布数据库,并开发数据管理和挖掘的在线平台,逐步整合植物性状数据、分子-组学数据、古植物学数据、环境数据和遥感数据。

  植物物种名录与分布数据库是本计划的核心部分,数据来源主要有:(1)植物志书、植物名录和相关论文;(2)植物分布图;(3)植物标本,包括鉴定可靠的植物照片;(4)植被调查样方;(5)植物考察资料;(6)植物观测资料,包括植物爱好者发布的数据;(7)数字化的在线数据集。

  除建设综合性数据平台服务于植物生态学、进化植物学、植物地理学、保护生物学和全球变化生物学研究之外,计划形成下列产出或者服务:(1)植物物种分布图;(2)植物多样性分布图;(3)国家或者区域植物物种名录;(4)植物学名校订和物种分布模型等数据清理与挖掘工具包和在线综合分析平台。

  “亚洲植物多样性数字化计划”以及“国家标本资源共享平台”实际上都可以为国家的“一带一路”倡议提供数据和平台支持,意义非凡。中国科学院陆续建立的海外研究中心为亚洲植物多样性数字化计划项目的开展提供了重要支持;中国政府以“走出去”为标志的新一轮开放战略,包括“一带一路”倡议,是亚洲植物多样性数字化计划等区域性项目得以施行的政治基础。有理由相信,亚洲植物多样性数字化计划定会通过大数据平台,雕刻亚洲的绿色未来。

  (作者:马克平,系中国科学院生物多样性委员会秘书长)

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编辑:guoai
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